DSpace Comunidad :http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/202024-03-12T08:46:03Z2024-03-12T08:46:03ZUtilización del gen 18s, como marcador genético para la identificación molecular de diatomeas epilíticasMishque Cevallos, Salomé Estefaníahttp://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/115602023-10-23T21:16:33Z2018-06-01T00:00:00ZTítulo : Utilización del gen 18s, como marcador genético para la identificación molecular de diatomeas epilíticas
Autor : Mishque Cevallos, Salomé Estefanía
Resumen : Las comunidades de diatomeas se encuentran presentes en todos los sistemas acuáticos siendo altamente sensibles a cualquier cambio en el estado ecológico, en particular a la concentración de los nutrientes, es por esta razón que son usadas como bioindicadores de la calidad de agua. Para ello, se han realizado identificaciones morfológicas que requieren de gran habilidad microscópica y el uso de guías taxonómicas. Para reducir la complejidad de identificación se han implementado herramientas moleculares basadas en códigos de barras genético que ayudan a complementar el biomonitoreo de los cuerpos de agua, siendo el mayor limitante para su uso la falta de secuencias de diatomeas epilíticas en el Ecuador.
El presente trabajo estuvo enmarcado en evaluar el uso potencial del gen 18SV4 como código de barras de ADN en diatomeas epilíticas del Ecuador, evaluando y comprobando su capacidad de discriminación entre las especies y la factibilidad de usar cebadores universales. Para ello fue necesario analizar las secuencias depositadas en el NCBI, de diatomeas epilíticas de diferentes orígenes, por medio de su alineamiento usando el programa UNIPROGEN determinando la región que presenta variabilidad interespecifica, y las zonas flanqueantes que permiten su amplificación en todas las especies. Se establecieron cultivos de diatomeas en el medio de cultivo CHU # 10, para poder realizar los análisis moleculares, extracción de ADN y amplificación por PCR.
No se pudo obtener un cultivo puro por lo que el trabajo se realizó con un cultivo mixto de algas verdes y diatomeas en el que se observaron por microscopia cuatro especies de diatomeas, que fueron identificadas con el uso de guías taxonómicas. Se extrajo el ADN del cultivo por dos métodos: Protocolo de Kit de aislamiento de ADN Power Soil y el Protocolo de extracción buffer, se establecieron las condiciones para la amplificación por PCR y finalmente se realizó una DGGE que permitió separar las bandas de ADN de 3 de las 4 especies presentes en el cultivo: Gomphonema langenula, Gomphonema parvulum, Navicula cataracta-rheni y Nitzchia acidoclinata
Descripción : The diatomaceous communities are present in all aquatic systems, being highly sensitive to any change in the ecological status, in particular to the concentration of nutrients. That is why they are used as bio indicators of water quality. To do this, morphological identifications have been made that require great microscopic skill and the use of taxonomic guides. To reduce the complexity of identification, molecular tools based on genetic barcodes have been implemented that help complement the biomonitoring of water bodies, the greatest limitation for their use being the lack of epithelial diatoms sequences in Ecuador to practice on.
The task presented was based on evaluating the potential use of the 18SV4 gene as a DNA barcode in the epilithic diatoms of Ecuador, evaluating and verifying its ability to differentiate between species and the feasibility of using universal primers. For this it was necessary to analyze the sequences deposited in the NCBI of epilithic diatoms of different origins, by analyzing their alignment using the UNIPROGEN program, which determined the regions that presented interspecific variability, and the flanking zones that allow their amplification in all species. Diatomaceous cultures were established in the CHU # 10 culture medium, in order to perform the molecular analyzes, DNA extraction and PCR amplification.
A pure culture could not be obtained, so the work was carried out with a mixed culture of green algae and diatoms in which four species of diatoms were observed under a microscope, which were then identified with the use of taxonomic guides. The DNA of the specific culture was extracted by two methods: The process using the Powersoil DNA isolation kit and the extraction buffer method. The conditions were established for the amplification by PCR and finally a DGGE was made that allowed the separation of the DNA bands of 3 of the 4 species present in the crop: Gomphonema langenula, Gomphonema parvulum, Navicula cataracta-rheni and Nitzchia acidoclinata2018-06-01T00:00:00ZValoración económica del servicio ambiental hídrico en el páramo de Pastocalle, cantón Latacunga, provincia de Cotopaxi, 2018.Pillo Arequipa, Tania Yadirahttp://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/115592023-10-23T21:15:19Z2018-08-01T00:00:00ZTítulo : Valoración económica del servicio ambiental hídrico en el páramo de Pastocalle, cantón Latacunga, provincia de Cotopaxi, 2018.
Autor : Pillo Arequipa, Tania Yadira
Resumen : La presente investigación se realizó con el objetivo de determinar el valor económico del servicio ambiental hídrico del páramo San Juan de Pastocalle, realizado en tres etapas: Determinación de las condiciones geográficas y físicas del área en estudio, mediante georreferenciación del páramo e información secundaria en formato shapefile para las variables: unidades hidrográficas, pendiente, uso potencial de suelo y cobertura vegetal. En la segunda etapa se realizó el estudio hidrológico, balance hídrico para determinar la oferta hídrica total y la oferta hídrica disponible del páramo de Pastocalle, mediante el cálculo de precipitación, temperatura, evapotranspiración y el costo de oportunidad que se obtuvo a través de encuestas a los productores, datos sistematizados en el software R. En la tercera etapa se calculó la disponibilidad de pago de los usuarios de las juntas administradoras de agua. La oferta total hídrica del área en estudio es de 36 509 412 m3 año-1, de esta oferta se pierde el 43 % por evapotranspiración, y 20 975 714 m3 año-1 de oferta hídrica disponible, Sin embargo, el 18% de esta agua ya está siendo utilizada por 40 juntas administradoras para los diferentes usos. El cálculo promedio del costo de oportunidad es de 3155 USD, de acuerdo a los resultados obtenidos se determinó el valor de productividad hídrica total del páramo siendo el valor anual por hectárea USD 262,8, el valor mensual por hectárea USD 55,2 esto equivale a un valor de 0,07 dólares por m3 de agua. Como una de las alternativas se considera que las juntas administradoras de agua compren los páramos o a su vez el Gobiernos autónomos en conjunto con el MAG, ONGs y el MAE financien a las juntas para proyectos ambientales y productivos para conservación, protección y recuperación del ecosistema páramo y sus fuentes hídricas.
Descripción : The present investigation was carried out with the objective to determine the economic value of the water environmental service of the San Juan de Pastocalle highlands, it was carried out on three stages: determination of the geographical and physical conditions of the area under study, by highlands georeference and secondary information in shapefile format for the variables: hydrographic units, slope, potential land use and vegetation cover. In the second stage, the hydrological study, water balance to determine the total water supply and the available water supply of the Pastocalle highlands, to calculate precipitation, temperature, evapotranspiration and the opportunity cost obtained through producers surveys, data systematized in the software R. On the third stage the availability of water users administration boards was calculated. The total water supply of the area under study is 36 509 412 m3 year-1, of this supply 43% is lost by evapotranspiration, and 20 975 714 m3 year-1 of available water supply, However, 18% of this Water is already being used by 40 management boards for different uses. The average calculation of the opportunity cost is 3155 USD, according to the obtained results, the total water productivity value of the highlands was determined. The annual value per hectare is USD 262.8, the monthly value per hectare is USD 55.2, which is equivalent to a value of 0.07 dollars per m3 of water. As one of the alternatives it is considered that the water management boards buy the highlands or in turn the autonomous governments in conjunction with the MAG, ONGs and the MAE finance the boards for environmental and productive projects for conservation, protection and recovery of the highlands ecosystem and its water sources.2018-08-01T00:00:00ZVariación espacio-temporal de fosfatos en la microcuenca del río Cutuchi utilizando técnicas de estimación geoestadística.Quispe Rodríguez, Angela Paulinahttp://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/115572023-10-23T21:14:27Z2018-08-01T00:00:00ZTítulo : Variación espacio-temporal de fosfatos en la microcuenca del río Cutuchi utilizando técnicas de estimación geoestadística.
Autor : Quispe Rodríguez, Angela Paulina
Resumen : El presente estudio evaluó la variación espacio- temporal de las concentraciones de fosfato en la Microcuenca del Río Cutuchi (MRC), la cual es parte del río Pastaza que nace en los páramos de los deshielos del volcán Cotopaxi, tiene un área de cuenca de 2677 km2 y una longitud aproximada de 60 km. La contaminación de los ríos por la concentración de fosfatos afecta alterando la eutrofización de las aguas superficiales. Para la investigación se utilizaron dos bases de datos, una de la Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC) y la otra de la Universidad Internacional SEK, las cuales fueron monitoreadas desde el mes de septiembre de 2010 a julio de 2011 por la UTC, y para la SEK desde el mes de octubre hasta abril del año 2017. Inicialmente se realizó un análisis exploratorio de datos (AED), para evaluar la distribución y el comportamiento de los datos, posteriormente se procesaron con el paquete interpolador Surfer y finalmente se realizaron los mapas de distribución espacial de fosfatos en la MRC. Como resultado, se obtuvo en el AED que los datos presentan poco outliers y completados con el criterio de la media se interpolaron para obtener los tres mejores interpoladores: polinomio local, medias móviles y regresión polinómica para las dos bases de datos que fueron valorados con el error medio cuadrático (EMC). Se concluyó que mediante los mejores interpoladores se obtuvo datos de fosfato en la MRC, que no fueron monitoreados y predecir su comportamiento de distribución, de esta manera se disminuye costos de tiempo y dinero que demanda el levantamiento de información de campo.
Descripción : The present research evaluated the variation spatio-temporal of the phosphate concentrations in Cutuchi River Microbasin (MRC), which is part of the Pastaza River, the CRM is born in the moors of Cotopaxi volcano thaws, it has an area 2677 km2 and 60 km legth. The rivers contamination phosphates concentration is affected by surface waters eutrophication altering eutrophication. For the investigation, two databases were used, one from the Technical University of Cotopaxi (UTC) and the other one from SEK University, which were monitored since September 2010 to July 2011 by UTC, and by SEK since October to April 2017. Initially, it was realized a data exploratory analysis (AED), to evaluate the distribution and behavior later they were procesed by the package of the Surfer interpolator and finally to realize the spatial distribution maps of phosphates in the MRC. As a result, data was obtained in the AED that has enough outliers, and completed with the mean were interpolated to obtain the three best interpolators: local polynomial, moving averages and polynomial regression for two databases that were valued with the mean square error (EMC). It was concluded that through the best interpolators, phosphate data was obtained in MRC, which were not monitored and to predict its distribution behavior, reducing costs of time and money that the gathering of information in the field would require.2018-08-01T00:00:00ZVariación espacio-temporal de fosfatos en la Microcuenca del río Cutuchi utilizando técnicas de estimación geoestadística.Quispe Rodríguez, Angela Paulinahttp://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/115562023-10-23T21:13:17Z2018-08-01T00:00:00ZTítulo : Variación espacio-temporal de fosfatos en la Microcuenca del río Cutuchi utilizando técnicas de estimación geoestadística.
Autor : Quispe Rodríguez, Angela Paulina
Resumen : El presente estudio evaluó la variación espacio- temporal de las concentraciones de fosfato en la Microcuenca del Río Cutuchi (MRC), la cual es parte del río Pastaza que nace en los páramos de los deshielos del volcán Cotopaxi, tiene un área de cuenca de 2677 km2 y una longitud aproximada de 60 km. La contaminación de los ríos por la concentración de fosfatos afecta alterando la eutrofización de las aguas superficiales. Para la investigación se utilizaron dos bases de datos, una de la Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC) y la otra de la Universidad Internacional SEK, las cuales fueron monitoreadas desde el mes de septiembre de 2010 a julio de 2011 por la UTC, y para la SEK desde el mes de octubre hasta abril del año 2017. Inicialmente se realizó un análisis exploratorio de datos (AED), para evaluar la distribución y el comportamiento de los datos, posteriormente se procesaron con el paquete interpolador Surfer y finalmente se realizaron los mapas de distribución espacial de fosfatos en la MRC. Como resultado, se obtuvo en el AED que los datos presentan poco outliers y completados con el criterio de la media se interpolaron para obtener los tres mejores interpoladores: polinomio local, medias móviles y regresión polinómica para las dos bases de datos que fueron valorados con el error medio cuadrático (EMC). Se concluyó que mediante los mejores interpoladores se obtuvo datos de fosfato en la MRC, que no fueron monitoreados y predecir su comportamiento de distribución, de esta manera se disminuye costos de tiempo y dinero que demanda el levantamiento de información de campo.
Descripción : The present research evaluated the variation spatio-temporal of the phosphate concentrations in Cutuchi River Microbasin (MRC), which is part of the Pastaza River, the CRM is born in the moors of Cotopaxi volcano thaws, it has an area 2677 km2 and 60 km legth. The rivers contamination phosphates concentration is affected by surface waters eutrophication altering eutrophication. For the investigation, two databases were used, one from the Technical University of Cotopaxi (UTC) and the other one from SEK University, which were monitored since September 2010 to July 2011 by UTC, and by SEK since October to April 2017. Initially, it was realized a data exploratory analysis (AED), to evaluate the distribution and behavior later they were procesed by the package of the Surfer interpolator and finally to realize the spatial distribution maps of phosphates in the MRC. As a result, data was obtained in the AED that has enough outliers, and completed with the mean were interpolated to obtain the three best interpolators: local polynomial, moving averages and polynomial regression for two databases that were valued with the mean square error (EMC). It was concluded that through the best interpolators, phosphate data was obtained in MRC, which were not monitored and to predict its distribution behavior, reducing costs of time and money that the gathering of information in the field would require.2018-08-01T00:00:00Z