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Tipo de Material: bachelorThesis
Título : Caracterización de la diversidad de resistencia antimicrobiana en los procesos de biodigestión para la reducción de escherichia coli blee de los residuos lecheros en la hacienda Lyg Farm en Quito – Ecuador.
Autor : Mancheno Saavedra, Rossana Carolina
Ponce Haro, Dilan Rafael
Director de Tesis: Molina Cuasapaz, Edie Gabriel
Descriptores: ESCHERICHIA COLI
BLEE
ANTIMICROBIANO
Fecha de publicación : mar-2022
Ciudad: Editorial: Ecuador : Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC)
Citación : Mancheno Saavedra Rossana Carolina, Ponce Haro Dilan Rafael (2022); Caracterización de la diversidad de resistencia antimicrobiana en los procesos de biodigestión para la reducción de escherichia coli blee de los residuos lecheros en la hacienda Lyg Farm en Quito – Ecuador. UTC. Latacunga. 148 p.
metadata.dc.format.extent: 148 páginas
Resumen : Las producciones bovinas lecheras de nuestro país no llevan un correcto manejo de los residuos pues terminan en fosas de almacenamiento, en fuentes hídricas y usados con fines agrícolas. El problema del mal manejo de residuos radica en la contaminación ambiental y en la diseminación de agentes patógenos, como la E. coli, catalogada como multirresistente. El uso excesivo e inadecuado de antimicrobianos a lo largo de los años, sobre todo, en producciones pecuarias ha provocado esto. Por lo cual, se realizó esta investigación con el objetivo de utilizar un biodigestor para reducir la cantidad de E. coli BLEE presente en los residuos lecheros. De modo que, se tomó 3 puntos de muestreo, al inicio (SP1), durante (SP2) y después (SP3) del proceso de biodigestión, y el recuento total de E. coli y E. coli BLEE se calculó mediante filtración en TBX y TBX combinado con 5 µl/ml cefotaxima, mientras que, la susceptibilidad a 21 antimicrobianos pertenecientes a 10 familias se evaluó mediante método Kirby-Bauer y los genes blaCTX-M grupos 1, 2, 8 y 9 se analizaron mediante PCR múltiple. SP1 cuantificó 2833.3 UFC/ml de E. coli BLEE, mientras que SP3 presentó 0.75 UFC/ml, su reducción podría ser por factores como la temperatura mesófila y la sintrofia debido a los microorganismos presentes en el biodigestor. Se aislaron 16 muestras de E. coli BLEE para su análisis, donde mostró multirresistencia a 15 de los 21 antimicrobianos usados, en SP1 se reportó resistencia a 7, mientras que SP3 se reportaron 14, el aumento se indicó por las características evolutivas de E. coli y otros factores que inciden en el proceso de biodigestión. Por otro lado, el análisis del gen blaCTX-M los grupos 2 y 8 fueron los que obtuvieron mayor prevalencia, inclusive el proceso de biodigestión redujo en un 75% la presencia de E. coli con el gen blaCTX-M-2 del SP1 al SP3. La investigación determinó que se redujo la presencia de E. coli BLEE, lo que permitiría obtener fertilizantes con menor presencia de patógenos siendo un beneficio para la salud pública, pero no es el caso de la resistencia antimicrobiana, ya que los mecanismos genéticos de la E. coli no permitió la reducción de esta, por lo que se tendría que determinar otros métodos que permitan reducir la multirresistencia.
Descripción : Dairy cattle production in our country does not have correct waste management since they end up in storage pits, in water sources, and used for agricultural purposes. The problem of poor waste management lies in environmental contamination and the dissemination of pathogenic agents, such as E. coli, classified as multi-resistant. The excessive and inadequate use of antimicrobials, especially in livestock production, has caused this. Therefore, this research was carried out to use a biodigester to reduce the amount of E. coli BLEE present in the dairy waste. So, three sampling points were taken, at the beginning (SP1), during (SP2), and after (SP3) the digestion process, and the total E. coli and E. coli BLEE counts were calculated. Coli BLEE counts were calculated by TBX filtration and TBX combined with 5 µl/ml cefotaxime, while susceptibility to 21 antimicrobials belonging to 10 families was evaluated by the Kirby-Bauer method and blaCTX-M genes groups 1, 2, 8 and 9 were analyzed by multiplex PCR. SP1 quantified 2833.3 CFU/ml of E. coli BLEE, while SP3 presented 0.75 CFU/ml. Its reduction could be due to mesophilic temperature and syntrophy due to the microorganisms present in the biodigester. Sixteen samples of E. coli BLEE were isolated for analysis, where it showed multi-resistance to 15 of the 21 antimicrobials used; SP1 reported resistance to 7, while SP3 reported 14. The increase was indicated by the evolutionary characteristics of E. coli and other factors that affect the digestion process. Then, in the blaCTX-M gene analysis, groups 2 and 8 obtained the highest prevalence, including the digestion process reduced by 75% the presence of E. coli with the blaCTX-M-2 gene from SP1 to SP3. The research determined that the presence of E. coli BLEE was reduced, which would allow obtaining fertilizers with less presence of pathogens being a benefit for public health. However, it is not the case of antimicrobial resistance since the genetic mechanisms of E. coli did not reduce this, so other methods that allow for reducing multi-resistance would have to be determined.
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