Análisis de consorcios bacterianos y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum), Var. Súper chola en el piso altitudinal de 3400 msnm. Cotopaxi. 2021
| dc.contributor.advisor | Chasi Vizuete, Paolo Wilman | |
| dc.contributor.author | Cruz Almagro, Francisco Javier | |
| dc.date.accessioned | 2022-03-15T19:49:49Z | |
| dc.date.available | 2022-03-15T19:49:49Z | |
| dc.date.issued | 2021-08 | |
| dc.description | The present research was carried out in the rhizosphere of the potato, a super chola variety in the altitude floor of 3400 meters above sea level in the community of Cuturuví Chico in the province of Cotopaxi, aimed at identifying bacterial consortia and determining the functional groups associated with the rhizosphere of the potato cultivation. Bacterial identification was carried out through the method of sequencing in nanopores with the MinION device, with amplification of the 16s genes of the sample and preparation of DNA libraries, for sequencing using the barcode kit for subsequent analysis of the resulting readings. in the 16S online bioinformatics flow at EPI2ME. For the analysis of the different functional groups, the methodology of (Bernal, Gustavo, 2005) was taken as a methodological reference, which was used for the determination of nitrogen-fixing bacteria, nitrogen-solubilizing bacteria, fungi, actinomycete, cellulolytic bacteria, pseudomonas. Of the aforementioned functional groups, five repetitions were carried out in soil and root plus a blind control where we obtained the number of colonies * gr-1 and the (Colony-forming units) CFU * gr -1 of each one. Additionally, to know the state of composition of the soil, a physical-chemical analysis was carried out and sent to the INIAP laboratory. From the data obtained in the research, it can be said that Enterobacteriaceae was identified as the dominant families in the soil sample with 34,238 accumulated readings, characterized by being phosphorus solubilizers and nitrogen fixers Followed by Xanthomonadaceae with 2,009 accumulated readings, which are characterized for possessing cellulolytic and nitrogen fixing bacteria. The most dominant genus is Raoultella with 1,949 cumulative readings, which are pathogenic disease-causing bacteria. Followed by Arenimonas with 1,002 accumulated readings, characterized by having phosphorus solubilizing bacteria. the most dominant species is Raoultella ornithinolytica with 1,097 accumulated readings, a species that is characterized by causing pathologies in cultivation. Followed by Arenimonas daechungensis with 949 accumulated readings, this family is characterized by having phosphorus solubilizing bacteria, this could influence the high nitrogen and phosphorus content obtained in the soil analysis with 43 ppm of N and 79 ppm of phosphorus (P) respectively The functional group with the highest number of colonies in this type of soil and altitudinal floor described above were Pseudomonas, where we found 3.56 * 107 Colonies * gr-1 in the soil sample and 3.41 * 107 Colonies * gr-1 in the Root sample which allows us to determine that there is a higher quantity of Pseudomonas in relation to the rest of the functional groups under study. In Colony Forming Units per gram of soil (CFU * gr-1), we find 3.04 * 107 CFU * gr-1 and 2.41 * 1012 in the soil sample of and 2.96 * 107 CFU * gr-1 in the root sample, which allows us to determine that there is a greater quantity of microorganisms associated with the potato rhizosphere in the soil sample. | es_ES |
| dc.description.abstract | La presente investigación se realizó en la rizosfera de la papa, variedad súper chola en el piso altitudinal de 3400 msnm en la comunidad de Cuturuví Chico de la provincia de Cotopaxi, tuvo como objetivo identificar consorcios bacterianos y determinar los grupos funcionales asociados a la rizosfera del cultivo de la papa. La identificación bacteriana se la realizó a través del método de secuenciación en nanoporos con dispositivo MinION, con amplificación de los genes 16s de la muestra y preparación de librerías de ADN, para secuenciar utilizando el kit de código de barras para posterior análisis de las lecturas resultantes en el flujo bioinformático online 16S en EPI2ME. Para el análisis de los diferentes grupos funcionales se tomó de referencia metodológica la metodología de (Bernal,Gustavo, 2005) misma que se utilizó para la determinación de bacterias fijadoras de nitrógeno, bacterias solubilizadoras de nitrógeno, hongos, actinomiceto, bacterias celulolíticas, pseudomonas. De los grupos funcionales antes mencionados se realizó cinco repeticiones en suelo y raíz más un testigo ciego donde obtuvimos el número de colonias *gr-1 y las (Unidades formadoras de colonias) UFC *gr -1 de cada uno. Adicional para conocer el estado de composición del suelo se realizó un análisis físico-químico que se envió al laboratorio del INIAP. De los datos obtenidos en la investigación se puede decir que se identificó como las familias dominantes en la muestra de suelo la Enterobacteriaceae con 34,238 lecturas acumuladas, caracterizan por ser solubilizadoras de fósforo y fijadoras de nitrógeno Seguido de Xanthomonadaceae con 2,009 lecturas acumuladas mismas que se caracteriza por poseer bacterias celulolíticas y fijadoras de nitrógeno. El género más dominante es Raoultella con 1,949 lecturas acumuladas, mismas que son bacterias patógenas causantes de enfermedades. Seguido de Arenimonas con 1,002 lecturas acumuladas, caracterizadas por poseer bacterias solubilizadoras de fósforo. la especie más dominante la Raoultella ornithinolytica con 1,097 lecturas acumuladas, especie que se caracteriza por causar patologías en el cultivo. Seguido de Arenimonas daechungensis con 949 lecturas acumuladas, esta familia se caracteriza por poseer bacterias solubilizadoras de fósforo, esto podría incidir en el alto contenido de nitrógeno y fósforo obtenido en el análisis de suelo con 43 ppm de N y 79 ppm de fósforo (P) respectivamente El grupo funcional de mayor numero de colonias en este tipo de suelo y piso altitudinal antes descrito fueron Pseudomonas donde encontramos 3,56*107 Colonias*gr-1 en la muestra de suelo y 3,41*107 Colonias*gr-1 en la muestra de raíz lo que nos permite determinar que existe una cantidad superior de Pseudomonas en relación al resto de grupos funcionales en estudio. En Unidades formadoras de colonias por gramo de suelo (UFC*gr-1), encontramos 3,04*107UFC*gr-1 y 2,41*1012 en la muestra de suelo de y 2,96*107 UFC*gr-1 en la muestra de raíz lo que nos permite determinar que existe mayor cantidad de microorganismos asociados a la rizosfera de la papa en la muestra de suelo. | es_ES |
| dc.format.extent | 145 páginas | es_ES |
| dc.identifier.citation | Cruz Almagro Francisco Javier (2021); Análisis de consorcios bacterianos y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum), Var. Súper chola en el piso altitudinal de 3400 msnm. Cotopaxi. 2021. UTC. Latacunga. 145 p. | es_ES |
| dc.identifier.other | PC-002148 | |
| dc.identifier.uri | http://repositorio.utc.edu.ec/handle/27000/8264 | |
| dc.language.iso | spa | es_ES |
| dc.publisher | Ecuador: Latacunga: Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC) | es_ES |
| dc.rights | openAccess | es_ES |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/ec/ | es_ES |
| dc.subject | CULTIVO DE LA PAPA | es_ES |
| dc.subject | IDENTIFICACIÓN BACTERIANA | es_ES |
| dc.subject | IDENTIFICAR CONSORCIOS BACTERIANOS | es_ES |
| dc.subject.other | AGRONÓMICA | es_ES |
| dc.title | Análisis de consorcios bacterianos y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum), Var. Súper chola en el piso altitudinal de 3400 msnm. Cotopaxi. 2021 | es_ES |
| dc.type | bachelorThesis | es_ES |