“Identificación morfológica y molecular de la cepa nativa (Beauveria SPP) 2023-2024”
| dc.contributor.advisor | Chancusig Espín, Edwin Marcelo | |
| dc.contributor.author | Farez Toapanta, Erick Dennis | |
| dc.date.accessioned | 2024-10-09T20:40:33Z | |
| dc.date.available | 2024-10-09T20:40:33Z | |
| dc.date.issued | 2024-08 | |
| dc.description | El presente trabajo de investigación realizado en el Laboratorio de Microbiología de la Universidad Técnica de Cotopaxi tuvo como objetivo identificar morfológica y molecularmente una cepa nativa de Beauveria spp, Se aplicó un enfoque bibliográfico con un diseño descriptivo. La metodología fue de carácter cualitativo y la técnica de recolección de datos bioinformáticos, fue in silico. Para la reactivación de las cepas se utilizaron métodos de multiplicación como bisturí, palillos y asa de siembra. Entre los resultados, se determinó que el bisturí resultó ser muy eficiente para obtener el aislamiento de Beauveria spp, ya que mostró mayor esterilidad y se logró inhibir la contaminación de las cajas Petri por bacterias. Además, se identificó las características macroscópicas de Beauveria spp. y se logró reconocer diversas estructuras morfológicas incluyendo hifas, conidióforos y conidios. También, se realizó la extracción manual de ADN del hongo, lo cual conllevó a optimizar el protocolo y adecuarlo a las condiciones del laboratorio. Asimismo, se estandarizó el protocolo para la amplificación por PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) de la región ITS (Internal Transcribed Spacer) del genoma del hongo y se verificó el tamaño del fragmento mediante electroforesis horizontal. Las muestras amplificadas fueron secuenciadas utilizando la secuenciación Sanger, a través de la empresa IDGEN. Se realizó el análisis bioinformático de las secuencias obtenidas utilizando el software Geneious Prime v2024.0.7, y se comparó la secuencia consenso frente a las reportadas en el NCBI (National Center for Biotchnology Information) a través del pipeline de BLASTn (Basic Local Alignment Search Tool). La identificación molecular determinó que el hongo correspondía a Trichoderma hamatum. Se dejó establecidas las bases de los protocolos de extracción manual de ADN de hongos, de amplificación por PCR de la región ITS y de análisis bioinformático. En conclusión, es vital identificar el género y especie de los hongos con los que se trabaja en el laboratorio con el objetivo de determinar la diversidad de los microorganismos y su potencial en la utilización de los mismos como controladores biológicos de plagas agrícolas; y de este modo promover prácticas, sostenibles y amigables con el ambiente en el manejo de cultivos y ecosistemas. | |
| dc.description.abstract | The objective of this research work was to morphologically and molecularly identify a native strain of Beauveria spp, from the Microbiology Laboratory of the Technical University of Cotopaxi. To reactivate the strains, multiplication methods such as scalpel, toothpicks and seeding loop were used. It was determined that the scalpel turned out to be the most efficient to obtain the isolation of Beauveria spp, since they showed greater sterility and managed to inhibit the contamination of the Petri dishes by bacteria. The macroscopic characteristics of Beauveria spp. Thus, it was possible to identify various morphological structures including hyphae, conidiophores and conidia. Subsequently, the manual extraction of DNA from the fungus was carried out, optimizing a protocol obtained from bibliographic sources and adapting it to the conditions found in the Microbiology laboratory of the Agronomy major. The protocol for PCR (Polymerase Chain Reaction) amplification of the ITS (Internal Transcribed Spacer) region of the fungal genome was standardized and the size of the fragment was verified by horizontal electrophoresis. Next, the amplified samples were sequenced using Sanger sequencing, through the IDGEN Company. Finally, the bioinformatic analysis of the sequences obtained was carried out using the Geneious Prime v2024.0.7 software, and the comparison of the consensus sequence against those reported in the NCBI (National Center for Biotechnology Information) was carried out through the BLASTn application (Basic local alignment search tool). Through molecular identification, it was determined that the fungus corresponded to Trichoderma hamatum. The bases of the protocols for manual extraction of fungal DNA, PCR amplification of the ITS region and bioinformatic analysis were established. It is necessary to carry out the molecular identification of fungi in the laboratory since this way we can know their genus and specific species for which it will contribute significantly to the characterization of microorganisms for the effective application as biological controllers of agricultural pests, thus promoting sustainable and friendly practices. With the environment in the management of crops and ecosystems. | |
| dc.format.extent | 51 páginas | |
| dc.identifier.citation | Farez Toapanta, Erick Dennis (2024), “Identificación morfológica y molecular de la cepa nativa (Beauveria SPP) 2023-2024”. UTC. Latacunga. 51 p. | |
| dc.identifier.other | PC-003343 | |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.utc.edu.ec/handle/123456789/12478 | |
| dc.language.iso | es | |
| dc.publisher | Ecuador : Latacunga : Universidad Técnica de Cotopaxi (UTC) | |
| dc.subject | BEAUVERIA SPP | |
| dc.subject | HONGO | |
| dc.subject | ADN | |
| dc.title | “Identificación morfológica y molecular de la cepa nativa (Beauveria SPP) 2023-2024” | |
| dc.type | Thesis |